MONOFONIC

Contenido

MONOFONIC#

Generador modular de condiciones iniciales (IC) de alta precisión para simulaciones cosmológicas. MUSIC2-monofonIC está diseñado para generar condiciones iniciales de caja completa (full box) sin zoom.

Versiones instaladas#

Dado que MONOFONIC no tiene versionado, el binario presente en el clúster corresponde al commit más reciente al momento de compilar el paquete, que es el 387ac9f.

Características:

Compilada con Intel OneAPI + OpenMPI 4.1.6
FFTW 3.3.9
HDF5 1.10.8
GSL 2.8

Como utilizar MONOFONIC#

Carga de módulo#

Usted podrá cargar MONOFONIC de la siguiente manera:

module purge
module load monofonic

Una vez hecho esto, podrá usar el binario monofonIC.

Scripts de ejemplo#

Script MPI puro#

1 Nodo

#!/bin/bash
#SBATCH --job-name=monofonic_test
#SBATCH --nodes=1
#SBATCH --ntasks=64
#SBATCH --time=00:30:00
#SBATCH --output=monofonic_%j.out
#SBATCH --error=monofonic_%j.err

module purge
module load monofonic

cp /data/shared/apps/monofonic/1.0/example.conf .
mpirun -np $SLURM_NTASKS monofonIC example.conf

2 Nodos

#!/bin/bash
#SBATCH --job-name=monofonic_test
#SBATCH --nodes=2
#SBATCH --ntasks=128
#SBATCH --time=00:30:00
#SBATCH --output=monofonic_%j.out
#SBATCH --error=monofonic_%j.err

module purge
module load monofonic

cp /data/shared/apps/monofonic/1.0/example.conf .
mpirun -np $SLURM_NTASKS monofonIC example.conf

URLs útiles#

Repositorio 1:
wullm/monofonic

Repositorio 2:
https://bitbucket.org/ohahn/monofonic

Wiki:
https://bitbucket.org/ohahn/monofonic/wiki/Home

Opciones para configuraciones de caso:
https://bitbucket.org/ohahn/monofonic/wiki/ConfigurationFile